1998年,吴卓羲参加TVB第七期跳舞艺员训练班。
2000年,他由古天乐推荐入读TVB艺员训练班第一期;12月,成为TVB全经理人合约艺人。
2003年,参演清装武侠剧《英雄・刀・少年》,在剧中饰演王五;10月,在吴镇宇、马德钟、陈慧珊主演的时装剧《
冲上云霄》中饰演言行不拘小节的唐亦风。
2004年7月,与林峰、李倩、杨怡共同主演古装武侠剧《大唐双龙传》,在剧中饰演外冷内热的徐子陵,并凭借此剧获得万千星辉颁奖典礼飞跃进步男艺员奖。
2005年2月,参演根据《
西厢记》改编而成的古装剧《西厢奇缘》,在剧中饰演书生张君瑞;4月,主演黄伟声监制的时装励志剧《学警雄心》,在剧中饰演领悟力强的钟立文;8月,正式签约BMA做歌手;8月15日,与马德钟、郭可盈合作拍摄的电视剧《酒店风云》播出,在剧中饰演性格偏激的王启杰;8月25日,主演的爱情片《拥抱每一刻花火》上映;12月,发行个人首张音乐专辑《特快通行》,成为首位出唱片的四小生,并凭借该专辑获得十大劲歌金曲最受欢迎男新人银奖。
2006年1月,吴卓羲在香港九龙会展中心举行个人音乐会,成为首位举行音乐会的四小生;6月,出演电视剧《男人之苦》,该剧讲述了康家两父子的故事,在剧中饰演乐观开朗、讲义气的康世熙;同年,发行第二张音乐专辑《Fast.Forward》。
2007年1月,与马浚伟、廖碧儿、徐子珊主演的电视剧《突围行动》播出,在剧中饰演斯文有礼、充满爱心的童日进;3月,在陈锦鸿、胡杏儿、唐宁主演的抗日剧《乱世佳人》中饰演乐于助人的田孝义;6月4日,参演的电视剧《学警出更》播出,该剧讲述了立文与柏翘等一众学警在警校毕业后,初任警察时所发生的事情,在剧中再度饰演钟立文;6月30日,出演为纪念香港主权移交十周年由TVB与中央电视台联合制作的时装商战剧《岁月风云》,在剧中饰演危介强。
2008年,参演由霍耀良执导的都市情感剧《浓情一生》,在剧中分饰李靖云和李熏风两个角色;7月,与姚芊羽合作拍摄的谍战剧《生死谍恋》播出,在剧中饰演唐问生;9月,出演由温瑞安小说改编的电视剧《
少年四大名捕》,在剧中饰演神捕司名捕冷血;同年,与岳华、邓萃雯、谢雪心、商天娥合作拍摄古装剧《巾帼枭雄》。
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009年2月,主演由TVB出品的学警系列剧集的第三辑《学警狙击》;11月,出演潘嘉德执导的怀旧时装剧《巴不得爸爸》,在剧中饰演楚帆的儿子楚慈;同年,与陈思成、马雅舒合作拍摄年代剧《大丫鬟》,在剧中饰演出身军阀之家的方少陵。
2010年,参演由黄伟声监制的情景喜剧《女王办公室》,在剧中饰演与家人缺乏沟通的凌笑淇。
2011年4月,与杨怡、陈豪、钟嘉欣共同主演的时装剧《点解阿Sir系阿Sir》播出,在剧中饰演督察程文力;6月,在郭晋安、陈锦鸿主演的电视剧《团圆》中饰演万昌盛集团副总裁翁以行;10月,出演TVB44周年台庆剧《法证先锋Ⅲ》,在剧中饰演西九龙重案组警长李展风。
2012年1月,出演家庭剧《缺宅男女》,在剧中饰演有上进心的股票经纪丁冠峰;10月,出演民国剧《名媛望族》,在剧中饰演金木水;同年,在古巨基、马苏主演的电视剧《春光灿烂之欢乐元帅》中饰演吴刚。
2013年7月,参演《冲上云霄》的续集《冲上云霄2》;同年,与江若琳合作拍摄情感剧《待嫁十年》。
2014年3月,出演警匪剧《叛逃》,在剧中饰演嫉恶如仇的庄有杰;7月,与郭晋安、田蕊妮合作拍摄的悬疑剧《
忠奸人》播出,在剧中饰演张立勋;9月,主演由舒仪同名网络小说改编的都市职场剧《
格子间女人》播出,在剧中饰演谭斌的上司程睿敏;12月,再度与胡杏儿合作拍摄古装爱情喜剧《醋娘子》,在剧中饰演计准。
2015年,主演由沈怡执导的电视剧《幸福归来》,在剧中饰演韩铭;8月15日,参演的都市浪漫爱情偶像剧《最佳前男友》播出,在剧中饰演程湘南前男友尹浩然;同年,主演民国剧《长梦留痕》。